科学家本（Zach暂无内容Galifianakis暂无内容饰）隶属于美国政府某个秘密部门，它通过高科技手段训练豚鼠说话与思考，并将它们培养成特工人员。然而，本的部门却面临被FBI关闭的局面，为了证明他和豚鼠特工的能力，本向豚鼠特工队的负责鼠达尔文（山姆·洛克威尔暂无内容Sam暂无内容Rockwell暂无内容配音）下令，要它们潜入赛博林工业的CEO罗纳德·赛博（Bill暂无内容Nighy暂无内容饰）的办公室，寻找罗纳德向中东国家出卖可用于军事的高科技芯片的证据。达尔文毫不怠慢，带着布拉斯特（崔西·摩根暂无内容Tracy暂无内容Morgan暂无内容配音）、华蕾斯（佩内洛普·克鲁兹暂无内容Penélope暂无内容Cruz暂无内容配音）、苍蝇莫奇和斯贝克斯（尼古拉斯·凯奇暂无内容Nicolas暂无内容Cage暂无内容配音）等成员迅速展开行动。